DeepMindのAlphaGenomeを試用した:ゲノム配列入力方式、対応アッセイを紹介、制約と活用法を整理した。
Google DeepMindが開発したAlphaGenomeは、ゲノム配列から機能を予測するAI。Mac mini(M2)環境で実際にセットアップした手順を解説。環境構築から動作確認まで段階的に説明。
膨張するCIViCエビデンス(例えばEGFR全変異268件)を活用するには自動要約が必須だ。自作スクリプトとLLMで解析し現行標準治療との整合性と抽出精度を検証、次段強化ポイントを整理した。
ベンチマークテストB(LLM連携CEA/CEA-MPXによるCIViC大量エビデンス自動要約とその評価)資料
ベンチマークテストA(LLM連携CEA/CEA-MPXによるCIViC大量エビデンス自動要約とその評価)資料
CIViCは臨床エビデンスを起点としたデータ構造に特徴があり、ライセンスによる制限がないため、生成AIによる分析の第一選択になる。
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