精密医療電脳書

分子標的薬 コンパニオン診断 肺がん ウイルス 人類観察

論文要旨集

Minami, D. et al. Use of a highly sensitive lung cancer compact panel to detect KRAS G12D in the wash fluid from a lung tumor: A case report. Thorac. Cancer 2022, 13, 1735–1738.

高感度肺がんコンパクトパネルの使用による肺腫瘍洗浄液からのKRAS G12Dの検出:症例報告

ごく少量の腫瘍細胞を含む腫瘍検体から,次世代シーケンサー(NGS)と最近開発された肺がんコンパクトパネルを用いて診断されたKRAS G12Dを保有する肺浸潤性粘液性腺がんの1例を報告する.呼吸器症状のない79歳の女性が胸部CT検査を受けたところ、左下葉に腫瘍があることが判明した。ガイドシース(GS)を用いた超音波内視鏡(EBUS)ガイド下経気管支生検(TBB)において、重度の咳嗽と腫瘍に隣接する肺水疱があったため、病理診断に十分な標本が得られなかった。ガイドシースを用いたEBUS経気管支生検所見がないため、ブラシ細胞診で腫瘍をクラスII(パパニコロウ分類)に分類した。しかし、細胞診の洗浄液には、シークエンス解析に使用する十分な核酸を得るための細胞が含まれていた。その結果、KRAS G12Dが発現していることが判明した。この患者は病理学的根拠がないまま手術を受けたが、手術標本の評価により肺浸潤性粘液性腺癌と診断された。肺がんコンパクトパネルの使用により、ブラシ細胞診サンプルの洗浄液からKRAS G12Dが検出され、肺浸潤性粘液性腺がんと診断された。戻る

 

Morikawa, K. et al. A Prospective Validation Study of Lung Cancer Gene Panel Testing Using Cytological Specimens. Cancers 2022, 14, 3784.

細胞診検体を用いた肺がん遺伝子パネル検査の前向き検証研究

遺伝子パネル検査は十分な組織検体を必要とするため、常実施することができないケースがある。細胞検体の採取は組織採取に比べ容易であるが、これまで細胞検体を用いた肺がん遺伝子パネル検査の診断精度に関する検証研究はない。新しく開発された8つの薬剤性遺伝子を測定できるアンプリコンベースの高感度次世代シーケンサーパネル検査を用い、診断処置を受けた連患者を前向きに登録した。ブラッシング、針吸引、胸水などの細胞診検体の解析精度、核酸収量、品質について評価した。さらに、これらの検体を採取した組織検体と比較した。結果は以下の通り:前向きに登録された163例において、腺がんと診断された症例では、核酸抽出および解析精度は100%であった。遺伝子変異は68.7%の症例で見つかり、コンパニオン診断との一致率は99.5%(95%CI:98.2-99.9)であった。DNA/RNA収量およびDNA/RNAインテグリティ数の中央値はそれぞれ475/321 ngおよび7.9/5.7であった。組織サンプルと比較した64例の遺伝子アレル比の相関係数は0.711であった。結論細胞検体を用いた遺伝子解析の成功率は高く,抽出された核酸の収量と品質はパネル解析に十分であった。さらに,細胞診標本における遺伝子変異のアレル頻度は,組織標本と高い相関を示した。戻る

 

Morikawa, K. et al. Preliminary Results of NGS Gene Panel Test Using NSCLC Sputum Cytology and Therapeutic Effect Using Corresponding Molecular-Targeted Drugs. Genes 2022, 13, 812.

NSCLC喀痰細胞診を用いたNGS遺伝子パネル検査の速報と対応する分子標的薬による治療効果について

進行性非小細胞肺がんに対する分子標的治療薬の上市が進むにつれ、初診時に遺伝子変異を同定するための一括検査が必要となってきている。しかし、現在の遺伝子パネル検査では十分な量の組織サンプルが必要なため、パネル検査が行えないケースも少なくない。そこで、我々は細胞診検体を簡便に行える高感度な次世代シーケンサー(NGS)パネルテストを開発した。ここでは、喀痰からのNGS解析を用いて、上皮成長因子受容体(EGFR)エクソン19欠失、METエクソン14スキッピング、KRAS G12Aが陽性となった3症例を紹介する。いずれの場合も、気管支鏡下で採取した組織サンプルから得られたコンパニオン診断解析と遺伝情報は一致していた。EGFRおよびMET変異の場合、対応するチロシンキナーゼ阻害剤が高い有効性を示した。本報告は、新規パネル検査により、臨床現場で喀痰サンプル中の遺伝子変異を検出し、病変部から直接採取したサンプルと遺伝子アレル比を比較できることを実証した最初の報告である。 戻る

 

Morikawa K . et al. (2022) RET fusion mutation detected by re-biopsy 7 years after initial cytotoxic chemotherapy: A case report. Front. Oncol. 12:1019932.

初回細胞毒性化学療法から7年後の再生検で発見されたRET融合遺伝子変異: 症例報告

肺がん治療では、より良い治療効果や長期予後を得るために、分子標的薬を用いた個別化医療が一般的に行われています。しかし、遺伝子一括検査が普及する以前は、希少な変異が検出されないまま治療が続けられていた。我々は、T1cN3M1a腺癌、ステージIVAと診断された67歳の男性について報告する。7年前に行われたEGFR変異とALK免疫組織化学検査による最初のスクリーニングは陰性であった。一次治療の細胞毒性併用化学療法は著効したが、原発巣の緩やかな退縮が認められた。最近の気管支鏡による再生検の結果、遺伝子パネル検査によりRET融合が検出された。また、7歳の胸水細胞ブロックから得られたFFPE標本からもRETを確認することができた。その後,分子標的薬selpercatinibを投与したところ,原発巣と脳転移を含むすべての転移巣に対して高い効果が得られた.分子標的治療と細胞毒性薬が劇的な効果を示し、長期治療が良好に維持されたRET融合陽性肺癌の1例を報告する。7年間未診断であったが、再生検標本を用いて次世代シーケンサーによりRET融合遺伝子変異を正しく診断することができた。 戻る

 

Kunimasa, K. et al. (2024) Clinical application of the Lung Cancer Compact Panel™ using various types of cytological specimens in patients with lung cancer.  Lung Cancer 189:107498. 

肺癌患者における各種細胞診検体を用いたLung Cancer Compact Panel™の臨床応用

背景. Lung Cancer Compact Panel™ (コンパクトパネル)は、腫瘍細胞を含む液体検体中のドライバー変異を高感度で検出できる遺伝子パネルである。本研究では、臨床で使用される液体検体におけるコンパクトパネルの遺伝子変異検出能を検討した。
方法. 気管支鏡下生検鉗子洗浄(洗浄コホート)、胸水(胸水コホート)、髄液(髄液コホート)の3つのコホートをコンパクトパネルを用いて解析した。液体サンプルはGM(Genemetrics)チューブに添加され、分析された。洗浄コホートでは、原発腫瘍由来の組織検体における遺伝子パネル解析結果の一致率を評価した。一方、胸膜コホートでは、8週間以上の検体保存が核酸および変異検出率に及ぼす影響を調査した。
結果. 洗浄コホート(n = 79)では、組織で検出された変異との一致率は75/79(94.9%)であった。この割合は、治療のためのドライバー変異のみに注目した場合、100%に達した。胸膜コホート(n = 8)では、GMチューブで8週間保存した後でも、核酸の質と量に劣化は見られなかった。同様に、脊髄コホート(n=9)では、悪性細胞を含む髄液が原発腫瘍と同様のドライバー変化を示した。これらの所見は、様々な液体検体中の遺伝子変異を正確に同定するコンパクトパネルの有効性を強調するものである。
結論. コンパクトパネルは、様々な細胞学的検体におけるドライバー変異を検出する信頼性の高いツールである。多様な種類の検体で一貫した性能を示すことから、肺癌患者の標的治療の指針となり、精密医療のアプローチを強化する可能性が強調される。 戻る

 

Morikawa K . et al. (2023) EML4-ALK Gene Mutation Detected with New NGS Lung Cancer Panel CDx Using Sputum Cytology in a Case of Advanced NSCLC. Diagnostics 13:2327. 

進行NSCLC症例における喀痰細胞診を用いた新しいNGS肺癌パネルCDxで検出されたEML4-ALK遺伝子変異

肺癌ではドライバー遺伝子変異の検出が必須となっているが、サンプルサイズが不十分であるため、遺伝子パネル検査は使いにくい。我々は以前、肺癌コンパクトパネルTM(LCCP)が喀痰細胞診でEGFRとMET遺伝子変異を検出できることを報告した。現在までのところ、喀痰検体からのRNAを用いた遺伝子変異の検出は現実的に困難であると考えられている。今回、次世代シークエンス肺癌パネルCDxとして日本で発売されたばかりのLCCPを用いて、喀痰検体からEML4-ALK融合遺伝子の検出に成功した症例を報告する。 戻る